马尔克斯自己曾说，《百年孤独》是一部历史纪实作品，整个故事的历史背景就是19世纪中期之后百年的哥伦比亚历史。这是动荡的一百年，内战与混乱不断，《百年孤独》(最明显地)提到了其中两个事件：千日战争（奥雷里亚诺·布恩迪亚上校四处征战）和联合水果公司大屠杀（何塞·阿尔卡蒂奥第二死里逃生）。本文将言简意赅地科普一下千日战争(La Guerra de los Mil Días, 1899-1902)。
 
两党之争
如《百年孤独》中所描述，千日战争是保守党(El Partido Conservador)和自由党( El Partido Liberal)的政治争端。历史上，这两个党派都曾在哥伦比亚独立执政数十年，哪个都不得民心。1885-1930年为保守党执政时期。千日战争发生于1899-1902年，以保守党的胜利告终。
保守党倾向于强大的中央政府，有限的投票权及政教联合。自由党则相反，提倡强大的地方政府，全民拥有投票权及政教分离。1899年底，在野的自由党怀疑总统选举存在舞弊，战争一触即发。
 《百年孤独》中，关于两党争端的解释，参见南海版《百年孤独》P85.
尼兰迪亚与威斯康星协定
1902年10月24日，尼兰迪亚协定(El Tratado de Neerlandia)签署。由于两党未达成任何政治上的共识，这份协定的性质仅仅是停火协定。这场内战正式结束于1902年11月21日，交战双方在美国军舰威斯康星号的甲板上签署了威斯康星协定。
在《百年孤独》中，尼兰迪亚协定的签署即代表着战争的结束。这个事件在全书中被反复提到。在马尔克斯的另一本小说《没有人给他写信的上校》(El coronel no tiene quien le escriba)中，尼兰迪亚协定的签署也是全书情节的核心大事件。
战争影响
这场战争对两党派的分歧没有任何积极的影响。正如《百年孤独》中马尔克斯上校所发现的，这是一场虚无的战争。名义上保守党是获胜者，然而经过三年多的激战，整个哥伦比亚都是输家。唯一的获利者是美国：1903年11月3日，美军在巴拿马登陆，在美国的支持下，巴拿马脱离哥伦比亚独立。15天后，美国从时任巴拿马政府那里取得了修建和经营巴拿马运河的永久垄断权。哥伦比亚永远失去了这块宝贵的领土。
注：本文中专有名词中文翻译参照南海出版公司版《百年孤独》（范晔译）。